Использование:
1. ИЗ командной строки из директории приложения: 
cd bin
java -cp c:\sun\sdk\jdk\jre\lib;..\lib;..\bin;..\lib\log4j-1.2.15.jar;..\lib\progress.jar;..\lib\messages.jar;..\lib\o4glrt.jar
org.spbu.benchmark.Launcher -t <количество потоков> <файл сценария>
Путь c:\sun\sdk нужно изменить так, чтобы он соответствовали пути к java
2. Из eclipse: импортировать проект, выбрать Launcher.java, Run as -> Java Application, указать параметры. 
Либо использовать API приложения, пример приведен в файле org.spbu.benchmark.app.Test.